生态环保问题与经济社会发展相生相伴。早在上世纪九十年代初，张家港市就创造了环境保护“三个一”的经验，其中一条就是“一把手亲自抓、负总责”。2004年，他们进一步提出了“绿色行政”的理念，要求各级政府和各级领导干部把生态和环保的理念贯穿于决策、管理和执行等各个环节。张家港市“绿色行政”突出表现为四个机制的形成：
一是科学规划机制。2001年，他们在全国第一个编制完成《生态市建设规划》并通过国家级专家评审。2003年，张家港市第十一届人大一次会议将创建生态市作为“一号议案”形成专门决议，作为政府的主要工作目标之一。根据《生态市建设规划》，他们又编制了《生态市创建实施方案》和《2003－2005年生态建设八项重点工程》，把生态创建工作细化分解成104项实事工程全面推进。同时配套编制了环保、循环经济、绿化、水利等31个子规划。镇和村也分别编制了环境优美镇、生态村建设规划，形成了市镇村三级生态规划体系。生态建设工程也坚持规划先行，暨阳湖生态园建设规划、双山生态岛建设规划、一干河生态景观带建设规划等，均采用国际招标形式，由国际知名咨询公司编制建设方案。
二是组织领导机制。市委、市政府成立了生态市创建工作领导小组，并组建了创建指挥部以及6个专业工作组，各镇、各开发区也建立了相应的创建工作机构，形成了各级、各部门齐抓共管的工作格局。他们聘请了国家环保总局金鉴明院士、清华大学环境科学与工程系主任陈吉宁教授等专家学者担任市生态建设的顾问，并邀请中国环境科学研究院生态所所长高吉喜研究员等专家教授给市里三级干部讲课。重大问题，做到不作深入调研不决策，不作科学论证不决策，不听专家意见不决策，确保了决策的科学性、准确性。
三是多元投入机制。实行“政府引导、政策扶持、多元投入”，市政府制定了《生态市建设奖励(补助)办法》。如对各镇生活污水处理厂、居民集中居住区建设地埋式生活污水处理设施，市财政按建设资金的30%给予配套；对市区“禁煤区”内燃煤锅炉改用清洁能源的每蒸吨补助2万元。同时，积极吸引社会资金，通过BOO、BOT等模式推进环境基础设施建设。
四是考核激励机制。确立了“绿色GDP”的理念，对各镇、各开发区实行经济指标和环境指标“双重考核”，“既考核GDP，又考核COD”。在年度“三个文明”千分考核中，生态、环境方面的考核分值达到150分，强化了领导干部守土有责和可持续发展的责任，有效调动了基层各级的积极性。
